合作开发具有抗 SARS-CoV-2 变体活性的新化合物
(相关资料图)
格勒诺布尔 EMBL 的 Márquez 小组与萨勒诺欧洲生物医学研究所 (EBRIS) 的意大利研究人员合作,开发并表征了一种新型小分子抑制剂,该抑制剂显示出针对三种 SARS-CoV-2 变体的良好活性。
在《欧洲药物化学杂志》上,科学家们描述了一代能够对抗 SARS-CoV-2 主要蛋白酶的化合物。其中一种化合物目前是开发抗 SARS-CoV-2 鼻内喷雾剂的临床候选化合物。此外,由于冠状病中靶向酶活性位点的氨基酸序列高度保守,该抑制剂可以治疗不同冠状病物种的感染。
由 Simone Di Micco 领导的意大利研究小组于 2020 年初开始研究 SARS-CoV-2。他们已经对新生物活性分子的设计感兴趣,并很快将之前关于乳糜泻的研究转向了这个新方向。虽然迪米科的团队可以使用计算机方法来设计针对病关键酶之一的新化合物,但他们没有办法弄清楚分子与其生物靶标之间的现实结合相互作用。
结构生物学是药物开发中分子生物学的一门重要学科。通过获得与其生物靶标相互作用的分子的原子结构,结构生物学家可以对其结合模式提供重要的见解,并利用这些信息来设计具有改进的亲和力和特异性的新分子。
由 EMBL Grenoble 和 ESRF 联合开发和运营的全自动 X 射线晶体学管道特别适合于此,因为它们可以快速筛选化合物库,并可用于识别结合生物靶标的小分子。
然而,迪米科的团队事先没有结构生物学方面的专业知识,也没有进行实验的设备。正是在此时,迪米科参加了由 Instruct-ERIC 主办的网络研讨会,Instruct-ERIC 是一个结构生物学研究基础设施,通过为欧洲研究人员提供高端技术和方法来为他们提供支持。
除了提供高质量的科学成果外,EMBL 的结构生物学服务还通过提供一系列通常基于 EMBL 开发的独特技术的方法和基础设施来支持整个欧洲的外部研究界。
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